2013年，万源市完成农林牧渔业总产值400607万元，比2012年增长3.9%。其中：农业产值224025万元，林业产值12500万元，牧业产值154271万元，渔业产值3991万元，农林牧渔服务业产值5820万元。全市粮食播种面积58124公顷，粮食总产量272262吨，比2012年增长0.4%。2013年末生猪存栏34.3万头，比2012年减少0.5%；牛存栏14.6万头，比2012年增长2.2%；羊存栏14.5万只，比2012年增长1.1%；家禽存栏158.1万只，比2012年增长29.9%。全年生猪出栏46.7万头，比2012年增长1.7%，牛、羊和家禽分别出栏4.3万头、15.5万只和382.9万只，分别增长2.4%、1.3%、8.5%。肉类总产量达到47993吨，比2012年增长4.5%；禽蛋产量3814吨，2012年增长5.9%。