南昌大学现有国家“双一流”建设学科1个（江西省唯一），省一流建设学科6个，一级学科博士学位授权点22个，专业博士学位授权点3个，一级学科硕士学位授权点49个，专业硕士学位授权点32个，二级学科硕士学位授权点1个，学科涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学、交叉学科等13个门类。14个学科进入ESI全球排名前1%，其中农业科学（以食品科学与工程为主）进入0.385‰，是江西省唯一进入1‰的学科。在全国第四轮学科评估中，食品科学与工程学科评估等级为A，位列全国第三位，在全国第五轮学科评估中，又获评顶级学科。